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ANOVAGET

ZPM-Translationsprojekt

Annotierung und Visualisierung genomischer und transkriptomischer Daten für MTBs

Molekulares Profiling, basierend auf den Ergebnissen von Next Generation Sequenzing (NGS) Analysen gehört zum Standard in Molekularen Tumorboards (MTBs). Dabei wird besonders auf Varianten und Alterationen der jeweiligen Patienten und Patientinnen eingegangen, sowie auch zunehmend das Transkriptom berücksichtigt. Um die bestmöglichen Therapien abseits der Leitlinien zu finden, werden Annotationen und Publikationen herangezogen, die die Entscheidungsfindung unterstützen. 
In diesem Verbund-Projekt sollen prototypische Softwareapplikationen zur Wissensanreicherung von Analyse-Ergebnissen erstellt werden. Diese Wissensquellen umfassen Annotierung, Visualisierung und Erweiterung der Daten von Patienten und Patientinnen aus kuratierten öffentlichen Quellen und Datenbanken. Die damit erstellten individualisierten Patienten-Reports können in MTBs als Diskussionsgrundlage zur Entscheidungsfindung dienen.

 

 

Leitung: Prof. Dr. Dr. M.Börries, Universitätsklinikum Freiburg; Prof. Dr. Hans A. Kestler, Universität Ulm; Dr. Sven Nahnsen, QBiC- Zentrum für Quantitative Biologie

Partner: ZPM-Freiburg, ZPM-Tübingen, ZPM-Ulm

Laufzeit: Juni 2020 - Februar 2022

Förderung im Rahmen des Förderprojektes "ZPM-Netzwerk BW" durch das Ministerium für Soziales und Integration, Baden-Württemberg.

Titelbild: @ Art Stock Creative / Adobe Stock (Ausschnitt)

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