Deutsch

Forschung

Home Forschung

Ganzexomanalyse für die Etablierung eines nationalen Standards

ZPM Onkologie

 

An den ZPM in Baden-Württemberg wird der Wandel von kleinen Genpanels zur Ganzexomanalyse vollzogen.

In den letzten 15 Jahren hat sich in der molekularen Analyse von Krebserkrankungen ein tiefgreifender Wandel vollzogen. Wurde im Jahr 2006 noch die Analyse einzelner Gene bei Darmkrebs eingeführt, werden heute mittels Next-Generation-Sequenzierung zahlreiche Gene eines Tumors parallel untersucht.

Aktuell sind sogenannte kleine Genpanels, bei denen die Anzahl der untersuchten Gene im dreistelligen Bereich ist, der Standard in der molekularen Diagnostik. Umfassendere Analysen werden in Zukunft aber eine immer größere Rolle spielen.

Bei der Ganzexomanalytik werden alle Bereiche des Erbguts, die für Proteine kodieren, die sogenannten Exome, untersucht. Sie stellt einen Zwischenschritt zur Ganzgenomanalytik dar, bei der die gesamte DNA analysiert wird.

Durch die umfassendere Analyse des Erbgutes von Tumoren können viele und vor allem auch bisher unbekannte mutierte Gene gefunden werden, die als Zielstrukturen für eine individuelle Therapie dienen könnten. Bestimmte Mutationen können aber auch die Wirksamkeit einer Therapie einschränken. Solche unbekannten Resistenzfaktoren können mit der Ganzexomanalyse auch gefunden werden. Unterschiede in der Kopienzahl von Genen, auch als copy number variation (CNV) bezeichnet, können den Verlauf einer Krebserkrankung beeinflussen und werden durch Ganzexomanalysen besser erkannt. Des Weiteren können parallel Mutationen gefunden werden, die an Kinder weitervererbt werden können.

In diesem Projekt soll die Ganzexomanalytik an den ZPM des Verbunds etabliert werden. Das ermöglicht innovative klinische Studienkonzepte, die in Zukunft an den ZPM des Verbundes durchgeführt werden können.

 

Leitung: Prof. Albrecht Stenzinger, Universitätsklinikum Heidelberg

Partner: ZPM-Heidelberg, ZPM-Ulm, ZPM-Freiburg, ZPM-Tübingen

Laufzeit: Juni 2021 – März 2023

Förderung im Rahmen des Förderprojektes "ZPM-Zukunftskonzept" durch das Ministerium für Soziales und Integration, Baden-Württemberg.

Titelbild: @ ipopba / Adobe Stock (Ausschnitt)

Weitere Projekte

AdobeStock 259048293

Mit bispezifischem Antikörper gegen Prostatakrebs

Ein Forschungsteam der ZPM hat einen Antikörper gegen Prostatakrebs entwickelt. Um Nebenwirkungen zu vermeiden will das Team herausfinden, für welche Betroffenen er geeignet ist.

Weiterlesen

ZPM Onkologie
AdobeStock 486784049 v3

Extrazelluläre Vesikel aus dem Blut für die Tumordiagnostik (EXO-DIA)

Mit Hilfe von Tumor-DNA aus dem Blut einfach und schnell komplexe Diagnostik zumachen und so das Risiko für Metastasen vorherzusagen, könnte vor allem bei heterogenen Tumoren einen Mehrwert bringen.

Weiterlesen

ZPM Onkologie
AdobeStock 282276008

Mikrobiom und Immunsystem bei Leberkrebs

Eine Gruppe von Forschenden an den ZPM will herausfinden, ob man anhand der Bakterien in Lebertumoren das richtige Medikament für den individuellen Tumor von Betroffenen finden kann.

Weiterlesen

ZPM Onkologie
Inno HP Bild Dietrich 3

MIRI-Plattform - Die Umgebung von Krebszellen sichtbar machen

Mit Immunfluoreszenzmikroskopen Immunprofile erstellen, um Resistenzmarker für zelluläre und medikamentenbasierte Immuntherapien in der Mikroumgebung von Krebszellen zu finden.

Weiterlesen

ZPM Onkologie
AdobeStock 250325329

Veränderung des Mikrobioms bei Schuppenflechte unter Biologika Therapie

Bakterien auf der Haut und im Darm haben einen Einfluss auf die Wirkung von Medikamenten. Kann man das Mikrobiom von Betroffenen nutzen um vorherzusagen, welche Therapie bei Schuppenflechte am besten anschlagen wird?

Weiterlesen

ZPM Entzündliche Erkrankungen
AdobeStock 268793354

Ganzexomanalyse für die Etablierung eines nationalen Standards

An den ZPM in Baden-Württemberg wird der Wandel von kleinen Genpanels zur Ganzexomanalyse vollzogen.

Weiterlesen

ZPM Onkologie
AdobeStock 402790894 v2

Prognose und Therapieansprechen bei Morbus Crohn

Forscher und Forscherinnen der ZPM wollen erschöpfte Immunzellen nutzen, um individuelle Therapien für den Morbus Crohn zu finden.

Weiterlesen

ZPM Entzündliche Erkrankungen
Hautarzt v2

Personalisierte Medizin bei Pustulösen Dermatosen

Die Personalisierte Medizin bei Pustulösen Dermatosen steckt noch in den Kinderschuhen. Eine Gruppe von Forschenden am ZPM will herausfinden, ob es individuelle Angriffspunkte im Immunsystem gibt.

Weiterlesen

ZPM Entzündliche Erkrankungen
AdobeStock 271705631

Personalisierte Therapieempfehlung bei Spondyloarthritiden

Mit der Kombination von Daten aus verschiedenen Bereichen der Personalisierten Medizin will eine Gruppe von Froschenden an den ZPM die Personalisierte Behandlung von Spondylarthritiden etablieren.

Weiterlesen

ZPM Entzündliche Erkrankungen

Impressum | Datenschutz | Cookie-Einstellungen